1999년 그룹 '아라시'로 데뷔했으며 데뷔 앨범 〈 A.Ra.Shi〉는 단숨에 오리콘 차트 1위로 등극하였다. 마츠모토 준은 1996년 5월 17일 일본 최고의 아이돌들을 배출해내는 유명한 '쟈니즈' 사무소에 들어왔는데, 입소가 힘든 것으로 알려져 있는 쟈니즈에 오디션 한번 없이 서류만으로 뽑힌 몇 안되는 "쟈니즈 엘리트" 중 한 명이다. 쟈니즈의 아이돌 그룹들이 그렇듯 그 역시 노래, 버라이어티, 연기 등 다방면으로 활약하고 있으며, 특유의 성실함으로 유명하다.
그의 첫 주연작은 드라마 〈소년 탐정 김전일〉(2001)이었다. 그 후 〈고쿠센〉(2002)을 통해 연기자로서 새로운 전기를 맞는다. 여기서 마츠모토 준은 냉정한 듯 보이지만 누구보다 친구들을 사랑하는 문제아 리더를 연기하며 기존의 유약한 이미지에서 남성적이고 터프한 매력을 선보이며 드라마아카데미상 최우수조연남우상을 수상했다. 이후 <너는 펫>(2003)에서는 다시 귀여움을, 영화 <도쿄타워>에서는 남성적인 매력을 물씬 풍기며 귀여운 소년의 이미지와 터프한 남성의 이미지를 겸비한 독특한 캐릭터를 구축, 일본은 물론 아시아 전역에서 큰 인기를 모았다. 2005년 10월 TBS 드라마 〈꽃보다 남자〉에서 남자주인공 도쿄지 츠카사 역을 맡아 최고스타로서의 입지를 더욱 공고히 했다.
연극 무대로는 〈 Stand By Me〉(97)로 첫 무대에 선 이후, 뮤지컬 〈 West Side Story〉(04), 〈에덴의 동쪽〉(05〉으로 좋은 반응을 얻었다.
2002년 제33회 일본TV드라마 아카데미상 남우조연상
2006년 제47회 드라마아카데미상 최우수조연남우상
2007년 제53회 드라마아카데미상 최우수남우주연상
